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首款國產分子育種固相基因芯片發布,驅動種業創新與糧食安全

蘇州2024年5月13日 /美通社/ -- 近期,蘇州拉索生物芯片科技有限公司聯合北京市農林科學院雜交小麥研究所北京小麥種子檢測中心、中國農業大學、西北農林科技大學等單位,成功研發出我國首款具備完全知識產權(涵蓋SNP標記、芯片、試劑及掃描儀)的高密度固相基因芯片——“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片(簡稱“華麥芯65K”)。這一創新成果不僅填補了我國在該技術領域的長期空白,打破了西方國家長達二十余年的技術壟斷,更是實現了關鍵核心技術的自主可控與全面國產化替代。

拉索生物高密度固相基因芯片
拉索生物高密度固相基因芯片

過去二十多年間,我國基因檢測行業高度依賴美國illumina和Affymetrix公司的固相芯片產品,高昂的采購成本與技術差距曾一度成為制約國內相關產業發展的因素,基因檢測成本居高不下,難以直接應用于分子育種相關研究和應用領域。國產高密度固相基因芯片的成功研發,無疑為我國分子育種事業的飛躍式發展開啟了新篇章。除了基因芯片,拉索生物還提供包含自研自產的掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內的一體化解決方案,有力推動了產業鏈的完善與優化。

拉索生物OmniScan芯片掃描儀
拉索生物OmniScan芯片掃描儀

面對近年來科技快速進步與成本壓力加劇,國內基因分型手段迅速發展,諸如“液相芯片”、“低深度重測序”等低成本、高通量的替代技術嶄露頭角。然而,這些技術均依賴測序完成基因分型,存在著數據處理復雜、檢測周期長、實驗結果存在隨機性等問題。當樣本量巨大,或者基因組復雜程度高時,檢測成本也隨之攀升。

相較之下,固相芯片以固態基底(如載玻片)上的寡核苷酸探針為基礎,無需依賴測序或其他基因分型技術,即可一次性并行檢測數十萬至數百萬個SNP位點,從檢測到數據分析,整個過程僅需72小時,且準確率保持在99%以上。對于農業育種來說,提前拿到分型結果意味著能夠更早地進行淘汰選擇,從而節省大量成本并提高生產效率。

微珠芯片構造示意圖
微珠芯片構造示意圖

此外,固相基因芯片在檢測靈活性上亦顯現出顯著優勢。用戶可根據需要隨時添加新的檢測位點,無需重新定制新的芯片。

尤其值得關注的是,固相基因芯片在規模化檢測時展現出顯著的成本效益。隨著樣本數量增加,單個樣本的檢測成本呈下降趨勢,經濟效益明顯。

截至目前,蘇州拉索生物芯片公司已獲得13項發明專利授權、2項實用新型專利授權、1張醫療器械注冊證,是中國法律體系下,在高密度固相基因芯片研發和生產領域知識產權布局最完善的公司。其主要供應商立足本土,不受國際環境波動影響,確保產品穩定供應。專業的本土技術支持團隊提供全程高效服務,確保用戶無憂使用。

拉索生物發明專利證書
拉索生物發明專利證書

“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片

華麥芯65K嚴格遵照《小麥品種真實性鑒定SNP標記法》(NY/T 4021-2021),囊括真實性鑒定和已知品種高密度指紋數據庫構建的所有位點,并整合轉基因檢測所必需的特定標記物,以及部分與小麥產量、品質、抗病等功能基因或緊密連鎖的SNP標記。以中國春2.1版本為參考,目前包含54993個精選的SNP標記(可根據未來研究重要結果擴充至65K),覆蓋196個性狀相關標記。SNP位點在A、B、D染色體上分布較均衡,多態性位點占比高達99.1%,具備良好的區分能力和穩定性;單個SNP位點采用15-30個微球重復檢測,平均檢出率高達99.0%,再現性高達99.5%。

華麥芯65K實物圖
華麥芯65K實物圖

結合國產高密度固相基因芯片制備技術,華麥芯65K具備以下顯著優勢:

全自主:從芯片制備到掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內的一體化解決方案均可自主實現。

可擴充:可根據需要在原有芯片基礎上隨時添加新的檢測位點,無需重新定制新的芯片,靈活性高、可塑性強。

多效用:該芯片集背景篩選、品種鑒定、轉基因檢測等多用途于一體,可實現一站式全面篩查,大幅提高檢測效率,并節約成本。

低成本:固相芯片在規模化檢測時展現出顯著的成本效益。隨著樣本數量增加,單個樣本的檢測成本呈下降趨勢,經濟效益明顯。

高效率:固相芯片以固態基底上的寡核苷酸探針為基礎,無需依賴測序或其他基因分型技術,即可一次性并行檢測數十萬至數百萬個SNP位點,從檢測到數據分析,整個過程僅需72小時,且準確率保持在99%以上。同時,僅需24個樣本即可完成檢測,無需湊樣。

芯片可廣泛應用于:小麥品種真實性/特異性/一致性輔助檢測,實質派生品種診斷,轉基因檢測,遺傳連鎖圖譜構建與QTL定位,全基因組選擇育種,標記輔助選擇育種等。

華麥“芯”普通小麥基因分型65K芯片的誕生,不僅為我國小麥育種工作提供了強大工具,更預示著我國固相基因芯片技術將在更多農作物種類及研究領域展現出巨大潛力。未來,拉索生物將持續聚焦玉米、大豆等主糧作物,以及生豬、肉雞、奶牛等多元化農業領域的育種技術革新,推動我國農業向更高效率、更高精度、更高自主性的方向大步邁進。

每一輪技術創新都有可能觸發農業革命,每一顆優質的種子都蘊含著豐產的希望。拉索生物正以實際行動踐行“通過國產自主研發和持續創新,推動基因檢測技術在更多場景的應用和普及”的宏偉愿景,為我國乃至全球的糧食安全與農業現代化進程貢獻力量。

消息來源:蘇州拉索生物芯片科技有限公司
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